近年来，随着组学技术的迅猛发展，这些技术已经成为生物医疗领域研究机制的重要工具。机体特征的表达涉及复杂的生命活动，基因突变、基因表达水平、蛋白质翻译后修饰及代谢结构变化等多种因素均对生物体特征产生影响。转录组能够反映细胞或组织在特定生物过程中活跃的基因表达，是连接基因组与蛋白质组的重要桥梁。与转录组相比，蛋白组更能直接反映生物体的功能状态，因为蛋白质在执行大多数生物功能中发挥着关键作用。转录组学捕捉基因的瞬时状态，而蛋白组学则展示基因的最终功能表现。

随着高通量测序技术的发展，转录组学已成为研究生物机制的优先选择，通过RNA-seq进行基因表达分析，显著推动了相关分子机制的探索。然而，仅靠mRNA的表达并不能完全反映蛋白质的表达情况，因为RNA在翻译过程中的调控和修饰可能导致转录和蛋白之间出现差异。与此同时，高分辨质谱仪的不断升级，使得蛋白质组学成为阐明细胞功能和分子机制的强有力工具，其联合分析在高水平论文中屡见不鲜。

将转录组与蛋白组结合，可以系统地研究基因表达与蛋白调控之间的相互关系。基因与蛋白质相互作用，形成特定的生物功能。例如，通过联合分析，可以研究基因的初始表达对蛋白质形成的影响，或挖掘基因表达产物对基因表达的负调控效应，从而深入探讨复杂的分子关系。

尊龙凯时(中国区)人生就是搏，在转录组和蛋白组的研究方案中，分析内容包括：

1. 转录组测序：包括差异基因火山图、差异基因热图、富集分析气泡图，以及富集通路的GSEA分析以全局把握基因的表达趋势。

2. 蛋白组分析：包括差异蛋白柱状图和韦恩图，展示差异蛋白的表达情况，以及富集分析气泡图，揭示不同处理下的差异蛋白功能。

3. 联合分析：基于富集通路进行共表达分析，挖掘关键调控物质，以及基于相关性分析筛选在转录和蛋白质水平之间共同表达的基因/蛋白，助力深入验证与功能相关的候选基因。

下面为大家分享两篇不同领域的转录组+蛋白组结合研究案例，展示如何利用这种分析方案撰写高水平论文：

01. 中文题目：神经嵴衍生物的环境线索在胚胎神经母细胞瘤模型中充当转移触发因素。发表于Nature Communications，影响因子147，发表时间：2022。研究表明，胚胎交感神经节和背根神经节对神经母细胞瘤细胞的影响涉及细胞的黏附、迁移及基因表达。通过转录组和蛋白组的联合分析，发现OLFM1作为一个关键蛋白介导了神经母细胞瘤细胞的转移。

02. 中文题目：通过转录组和蛋白质组的比较，揭示低温对大蒜变绿的调控机制。发表于Food Research International，影响因子70，发表时间：2022。研究发现，低温贮藏导致大蒜在基因和蛋白质水平上呈现显著的表达差异，尤其是与谷胱甘肽代谢和能量代谢相关的通路，明确了在低温调控大蒜绿化过程中的重要角色。

总结而言，蛋白质组学作为转录组学和基因组学的重要补充，能够深入揭示基因表达与生物功能之间的复杂关系。通过尊龙凯时(中国区)人生就是搏，这一联合分析方法不仅提高了我们对功能基因或蛋白的定位准确性，同时增强了对生物相互作用网络的理解。